Ultra Defrag ist schneller als die Windows-eigene Defragmentierungsapplikation, da es dafür den Kernel-Modus benutzt. Es lässt sich per grafischen User-Interface (GUI) betreiben, aber auch im Command-Promt. Dateiverschiebungen werden trotzdem mit Microsofts Defrag API durchgeführt - dadurch ist dieses Tool sicher.